6月17日,由黄金城集团主办的“溯本求源 对话时空-单细胞时空多组学技术论坛”在京召开,本次会议发布了黄金城集团在时空组学大规格芯片(定制1×2,2×2,3×4等)的项目经验及时空组学在植物领域的开发应用方案,为单细胞时空组学在生物学领域的应用开拓新道路。
Stereo-seq芯片大小示例
植物包埋切片染色图
此次技术论坛由黄金城集团携手华大时空组学,华大智造共同举办,论坛吸引了众多来自生物学和医学领域的知名专家、学者,共同围绕单细胞测序和时空组学技术在生长发育、复杂疾病和肿瘤基础研究等方面的最新研究成果开展深入的学术交流。
黄金城集团生产交付中心总经理武旺、华大智造北区大客户销售经理刘竹琳、华大生命科学研究院时空组学领域首席科学家陈奥博士均在致辞中表示单细胞时空组学技术的迅猛发展,刷新了科学家们对生命科学领域的认知。黄金城集团等作为单细胞测序和时空组学技术的服务提供商,将紧跟单细胞技术和时空组学技术进步和发展的步伐,积极推动生命科学领域的不断探索和创新。接下来是会场的精彩报告部分。
1、《单细胞转录组测序技术在肿瘤免疫治疗研究中的应用》
赵海涛教授以单细胞时空组学技术应用者的视角讲述了如何应用单细胞转录组测序技术探究肿瘤异质性、绘制肿瘤免疫微环境的细胞图谱、发现肿瘤微环境中新的细胞亚群、预测免疫治疗应答的生物标志物、寻找免疫治疗靶点等方面的应用场景。
北京协和医院教授 赵海涛
2、《TDO2+ myofibroblasts mediate immune suppression in malignant transformation of squamous cell carcinoma》
白凡教授分享了所在团队最新的研究成果:TDO2+肌成纤维细胞在介导口腔鳞状细胞癌恶性转化中的免疫抑制。从样本收集、实验设计和研究成果等方面详细讲解了单细胞测序技术是如何揭示口腔癌变关键调控机制以及发现新的治疗靶点。
北京大学教授 白凡
3、《高龄女性卵巢的细胞与分子特征》
于洋研究员介绍了单细胞测序技术在解析高龄女性卵巢的细胞与分子特征中的应用,研究发现颗粒细胞作为卵泡的关键组成部分,提供了卵母细胞发育、成熟和功能形成的微环境,为探索高龄女性卵巢功能的恢复和保护策略提供了思路。
北京大学第三医院研究员 于洋
4、《高精度、大视场时空多组学技术的研发与应用》
华大生命科学研究院时空工具主任科学家廖莎,在论坛上详细讲解了时空组学技术Stereo-seq的技术原理,介绍了华大时空组学多项最新技术的研发进展,包括时空单细胞、时空多组学以及3D时空组学技术等。同时,廖莎分享了华大时空组学在全尺寸芯片工具生态上的布局,发布了新品芯片S0.5。
华大生命科学研究院时空工具主任科学家 廖莎
5、《反刍动物重要器官起源与发育的分子基础》
反刍动物梅花鹿鹿角的再生能力是生物领域探寻的奥秘之一,为了探索上述问题,李志鹏教授团队研究了梅花鹿鹿角再生过程,建立了鹿角再生的时空细胞图谱,为哺乳动物器官再生提供了非常有价值的遗传和组织学方面的科学依据。
吉林农业大学教授 李志鹏
6、《空间组学联合单细胞转录组解析肿瘤恶性机制》
张晓鲁教授评价单细胞多组学技术是解析肿瘤内细胞异质性的一把利器,以非小细胞肺癌为例讲述了如何将单细胞转录组和时空组学联动应用解析恶性肿瘤的发生和发展机制,并对单细胞和时空组学未来的技术应用进行了展望。
山东大学基础医学院教授 张晓鲁
7、《缺氧小鼠单细胞图谱》
华大生命科学研究院邓子卿副研究员报告主要关于研究缺氧诱导的常见细胞变化,并观察到主要响应缺氧反应的基因集。更重要的是,发现了一种低氧诱导的新型细胞类型,具有重要免疫调节作用。本研究为低氧引起的生理变化的分子机制提供了新的见解;并对间歇性低氧干预特定疾病进行了探索。研究中应用DNBelab C4平台构建缺氧小鼠单细胞图谱。
华大生命科学研究院副研究员 邓子卿
8、《单细胞和空间转录组联合分析方法》
苑赞经理介绍了安诺STO空间转录组定制大芯片的项目经验以及植物空间转录组的研发进展和在藤本科植物上的成功案例;讲解了单细胞和空间转录组联合分析的4种方法,多种算法满足科研用户的不同需求;最后分享了三维基因组技术和单细胞技术联合应用的项目方案,为广大研究学者提供技术应用思路。
黄金城集团大项目生物信息专家 苑赞
9、《单细胞转录组解析心肌再生机制》
聂宇研究员以如何开展一个单细胞测序课题为起点,层层递进,重点讲解了心肌再生机制,通过构建动物模型对心肌再生过程中的心肌细胞进行单细胞转录组测序,发现巨噬细胞可以通过分泌炎症因子,激活gp130受体,促进心肌细胞增殖和心脏再生,为心血管疾病的治疗提供了新的干预靶点。
中国医学科学院阜外医院研究员 聂宇
10、《单细胞多组学解析下丘脑细胞谱系》
哺乳动物的下丘脑由多种结构及功能复杂的细胞核团构成。吴青峰研究员研究团队通过结合单细胞转录组学和时空组学的方法揭示下丘脑的模式生成和神经发生过程,并系统性重构了下丘脑的亚谱系,揭示谱系因子对下丘脑神经元命运决定的阶梯性调控。
中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员 吴青峰
11、《灵长类胚胎与胎盘发育》
中国科学院动物研究所王红梅团队的翟晶磊副研究员分享了以食蟹猴为模型,利用单细胞转录组测序技术构建了食蟹猴全妊娠周期胎盘和子宫蜕膜及早期胚胎单细胞转录组图谱的研究成果,为解析灵长类动物胎盘的发育机制提供了重要数据和理论基础。
中国科学院动物研究所副研究员 翟晶磊
12、《DNBelab C4单细胞组学平台及应用》
吴洁经理介绍了华大智造单细胞全流程产品和应用。华大智造的DNBelab C系列 高通量单细胞RNA文库制备试剂盒套装,采用小巧便携的DNBelab C4装置,无需电源,无需安装和维护,只需轻轻一拉便可实现单细胞液滴生成,堪称“可装进口袋的单细胞实验室”,简化了仪器的操作难度,并降低了单细胞研究的门槛。
华大智造中国区单细胞产品经理 吴洁
本次单细胞时空多组学技术论坛为致力于利用单细胞和时空组学技术解决生命科学重大问题的专家学者提供了很好的交流平台,从技术开发者、产品服务商和科研用户端不同的角度展望单细胞和时空组学的发展进程。期待未来多方一起增进合作,使得单细胞测序和时空组学技术在动植物生长发育、复杂疾病的发病机制和免疫治疗机制研究中大放异彩,推动生命科学研究和技术创新取得更多突破,用基因科技和创新提升生命品质!